Влияние генотипа СС-хемокинового лиганда 2 и содержания СС- хемокинового лиганда 2 в ликворе на нейрокогнитивную функцию у ВИЧ-пациентов
The role of chemokine C-C motif ligand 2 genotype and cerebrospinal fluid chemokine C-C motif ligand 2 in neurocognition among HIV-infected patients
Раскрыть Закрыть
Objectives: We examined interrelationships between chemokine C-C motif ligand 2 (CCL2) genotype and expression of inflammatory markers in the cerebrospinal fluid (CSF), plasma viral load, CD4+ cell count and neurocognitive functioning among HIV-infected adults. We hypothesized that HIV-positive carriers of the ‘risk’ CCL2 -2578G allele, caused by a single nucleotide polymorphism (SNP) at rs1024611, would have a higher concentration of CCL2 in CSF, and that CSF CCL2 would be associated with both higher concentrations of other proinflammatory markers in CSF and worse neurocognitive functioning.
Design: A cross-sectional study of 145 HIV-infected individuals enrolled in the National NeuroAIDS Tissue Consortium cohort for whom genotyping, CSF and neurocognitive data were available.
Methods: Genomic DNA was extracted from peripheral blood mononuclear cells and/or frozen tissue specimens. CSF levels of CCL2, interleukin (IL)-2, IL-6, tumour necrosis factor-alpha (TNF-α), interferon-gamma (IFN-γ), soluble tumor necrosis factor receptor 2, sIL-6Rα, sIL-2, sCD14 and B-cell activating factor were quantified. Neurocognitive functioning was measured using a comprehensive battery of neuropsychological tests.
Results: Carriers of the CCL2 -2578G allele had a significantly higher concentration of CCL2 in CSF. CSF CCL2 level was positively and significantly associated with other CSF neuroinflammatory markers and worse cognitive functioning. There was a significant association between genotype and plasma viral load, such that carriers of the CCL2 -2578G allele with high viral load expressed greater levels of CCL2 and had higher neurocognitive deficit scores than other genotype/viral load groups.
Conclusion: Individuals with the CCL2 -2578G allele had higher levels of CCL2 in CSF, which was associated with increased pro-inflammatory markers in CSF and worse neurocognitive functioning. The results highlight the potential role of intermediate phenotypes in studies of genotype and cognition.
Цель. Изучена связь между генотипом СС-хемокинового лиганда 2 ( CCL ) и экспрессией маркеров воспаления в ликворе, ВН в плазме, числом CD4, и нейрокогнитивной функцией у ВИЧ-инфицированных взрослых пациентов. В соответствии с нашим предположением, у носителей аллеля CCL2 -2578G , обусловленного наличием однонуклеотидного полиморфизма в участке rs1024611, будут отмечаться более высокие концентрации CCL2 в ликворе, при этом повышение CCL2 будет связано с повышением других маркеров воспаления в ликворе и ухудшением когнитивной функции.
Дизайн. Поперечное исследование у пациентов из когорты National NeuroAIDS Tissue Consortium - 145 пациентов,у которых было выполнено генотипирование и исследование ликвора,с оценкой когнитивной функции.
Методы. Геномную ДНК выделяли из мононуклеарных клеток крови и/или замороженных образцов тканей. Было выполнено количественное определение в ликворе уровня CCL2, интерлейкина-2 ( IL-2), интерлейкина-6 ( IL-6 ), фактора некроза опухолей а (TNF-α), интерферона -γ (IFN-γ) , растворимого фактора некроза опухолей 2, sIL-6Rα, sIL-2, sCD14, фактора активации B-лимфоцитов. Нейрокогнитивную функцию оценивали набором психологических тестов.
Результаты. У носителей аллеля CCL2 -2578G были выявлены значительно более высокие концентрации CCL2 в спинномозговой жидкости. Уровень CCL2 в ней имел статистически значимую корреляцию с титрами других провоспалительных маркеров в спинномозговой жидкости и с ухудшением когнитивных функций. Обнаружена явная и выраженная связь между генотипом и ВН в плазме,у носителей аллеля CCL2 -2578G с высокой ВН выявлялись более высокие уровни CCL2 и обнаруживался более выраженный когнитивный дефицит, в сравнении с другим генотипом и другой ВН.
Заключение. Пациенты, носители аллеля CCL2 -2578G, демонстрировали более высокий уровень CCL2 в ликворе,это ассоциировалось с повышением уровня провоспалительных маркеров в ликворе и ухудшением когнитивных функций.Данные результаты показывают потенциальную роль промежуточных фенотипов в будущих исследованиях генотипа и когнитивных функций.
AIDS 2015,29(12):1483-1491
* По сути,это показывает,что генез когнитивного дефицита при ВИЧ-инфекции в определенной мере заложен в генотипе человека, отчасти это объясняет,почему у одних людей при глубоком СПИДе развивается нейроспид, а у других, при схожих параметрах- нет. Также см. Когнитивные нарушения у вич-инфицированных: не кроется ли здесь эпидемия ?
Re: Влияние генотипа СС-хемокинового лиганда 2 и содержания СС- хемокинового лиганда 2 в ликворе на нейрокогнитивную функцию у ВИЧ-пациентов
Цитата:
145 HIV-infected individuals enrolled in the National NeuroAIDS Tissue Consortium cohort
Так как есть подозрение, что пациенты в эту группу попали не просто так, то само исследование как-то не вызывает доверия.
Re: Влияние генотипа СС-хемокинового лиганда 2 и содержания СС- хемокинового лиганда 2 в ликворе на нейрокогнитивную функцию у ВИЧ-пациентов
Конечно, они попали не просто так, мало того, данная практика явл. обычной для клинических исследований : это субисследование в рамках другого исследования. ( пример ) Довольно часто когорта или регистр ведут к нескольких исследованиям или анализам,которые становятся самостоятельным исследованием.
Re: Влияние генотипа СС-хемокинового лиганда 2 и содержания СС- хемокинового лиганда 2 в ликворе на нейрокогнитивную функцию у ВИЧ-пациентов
Ну смотрите: если все 145 пациентов были из группы NeuroAIDS , то ваше заключение о том, что у кого-то нейроСПИД развивается, а у кого-то нет (в зависимости от наличия определенного гена) было бы правильно переформулировать вот так, например.
Если у пациента развивается нейроСПИД, то наличие определенного гена ведет к существенному ухудшению когнитивных функций по сравнению с пациентами, этого гена не имеющими.
Очевидно же, что к пациентам, у которых никакого нейроСПИДа не развилось, данный вывод отношения не имеет.
Re: Влияние генотипа СС-хемокинового лиганда 2 и содержания СС- хемокинового лиганда 2 в ликворе на нейрокогнитивную функцию у ВИЧ-пациентов
Собственно, то, что я написал, бросается в глаза сразу. Но есть и другие вещи, которые могут обесценить такого рода исследования. В первую очередь, это стандартная ошибка, связанная с неправильным применением статистических методов.
Например, как обычно такие исследования проводят? Изучают в какой-то относительно небольшой группе несколько десятков параметров, а потом просто забиваются результаты в программу, которая считает парные корреляции. И проблема тут в чем...Если мы возьмем, например, группу из 145 человек, разделим ее пополам: на тех, у кого сохранились когнитивные функции, и тех, кто их существенно утратил — и возьмем несколько десятков разных параметров (наличие разных генов, величины разных маркеров и т.д.), то с высокой вероятностью какие-то параметры в этих двух группах будут отличаться. И реально никакой причинно-следственной связи стоять за этим не будет, просто случайность и все. То есть если взять другую группу из 145 человек, то существенно отличаться друг от друга будут какие-то совсем другие параметры.
Давайте объясню примером с монетой. Предположим мы взяли идеальную монету и бросили ее 10000 раз, вот несколько суток стояли и "исследовали". В результате, с высокой вероятностью у нас получатся какие-то отрезки из 100 бросков с большим перекосом в результатах: например, 80-20. После чего, если мы "продвинутые исследователи", то можем смело публиковаться с выводом вроде: наш опыт показал, что между 2 и 3 часами дня монета падает чаще орлом.
Утверждать, что данное исследование с нейроСПИДом проходило по похожему сценарию, я не могу. Из абстракта, который доступен по ссылке, это непонятно. Но подозрения такие есть, в первую очередь вследствие того обстоятельства, что "это субисследование в рамках другого исследования". То есть изначально изучали, например, несколько десятков-сотен генов, в каких-то нашли отклонения — выдали отдельное субисследование с соответствующим выводом.
Re: Влияние генотипа СС-хемокинового лиганда 2 и содержания СС- хемокинового лиганда 2 в ликворе на нейрокогнитивную функцию у ВИЧ-пациентов
Цитата:
Сообщение от
Vassy
То есть изначально изучали, например, несколько десятков-сотен генов, в каких-то нашли отклонения — выдали отдельное субисследование с соответствующим выводом.
Мутация CCL2 и мутация в рецепторе CCL2 , предрасполагающие к когнитивному дефициту ( у их носителей чаще развиваются выраженные расстройства, вплоть до деменции), были обнаружены несколько лет назад, именно они вызывают инфильтрацию ЦНС моноцитами , в частности, нейроглии, это и есть поражающий фактор.Один и тот же вопрос уточняется многократно, если это принципиально что-то важное. А это принципиально важное, если тяжелое поражение ЦНС уже развилось, на современном уровне развития медицины нет способов его хорошей обратимости. Возможно, такую мутацию можно заблокировать неким сконструированным моноклональным антителом и снизить или заблокировать совсем моноцитарную инфильтрацию,хотя бы на время,что дало бы таким больным намного больше шансов на выживание. От идеи до её реализации и выход на рынок проходит много времени. На алирокумаб, если не ошибаюсь, ушло больше 10 лет.
Re: Влияние генотипа СС-хемокинового лиганда 2 и содержания СС- хемокинового лиганда 2 в ликворе на нейрокогнитивную функцию у ВИЧ-пациентов
Я в недоумении: кликнул по вашей ссылке, почитал материал — там рассказывается о пилотном исследовании влияния антибиотика под названием Minocycline (из группы тетрациклинов) на пораженную ВИЧ центральную нервную систему. Про генетические отклонения, мутации и пр. ничего не увидел. CSF CCL2 — это какой-то белок из ликвора, являющийся одним из воспалительных маркеров.
Re: Влияние генотипа СС-хемокинового лиганда 2 и содержания СС- хемокинового лиганда 2 в ликворе на нейрокогнитивную функцию у ВИЧ-пациентов
